Notre Equipe
Bernard DUMAS
DR CNRS Responsable Equipe
Marie-thérèse ESQUERRE-TUGAYE
Profeseur Emérite
Elodie GAULIN
Maître de Conférences
Laurent CAMBORDE
Ingénieur d'Etudes CNRS
Maryam Hashemi
Doctorante
Marion Hortala
IE CDD
Andreï Kiselev
Doctorant
Moustafa Khatib
Post-doctorant
Anciens membres
Research Topics
Les interactions entre les plantes et les microorganismes peuvent conduire à des maladies dont les plus dommageables sont causées par les champignons filamenteux et des organismes apparentés appelés oomycètes. Nos travaux sont centrés sur la recherche des signaux à l’interface entre les plantes, les champignons et les oomycètes (Aphanomyces) pathogènes. La légumineuse Medicago truncatula a été choisie comme plante modèle pour ces études. L’objectif est de fournir les clés de nouvelles stratégies phytosanitaires.
Nos recherches sont organisées en deux volets complémentaires qui abordent :
– L’étude de molécules microbiennes appelées effecteurs, dont la fonction contribue au pouvoir pathogène ou à l’élaboration des structures des surfaces des microorganismes, et dont la perception induit des réactions de défense dans les plantes.
– L’identification des déterminants génétiques impliqués dans la perception des parasites et la mise en place des réactions de défense chez la plante hôte.
Thèmes de Recherche
La légumineuse modèle Medicago truncatula est particulièrement adaptée à l’étude des interactions qui se mettent en place au niveau de ses racines avec des microorganismes pathogènes ou symbiotiques. Au cours des dernières années, l’équipe a développé différentes approches et méthodologies, fondées sur l’exploitation des ressources génomiques et génétiques disponibles pour cette plante afin
1- d’étudier le déterminisme génétique de la résistance quantitative à Aphanomyces euteiches, principal parasite du pois en France et en Europe.
2- d’analyser les connections qui peuvent exister entre immunité et symbiose chez les légumineuses.
3- d’identifier des traces génétiques de sélection dans le génome reflétant son adaptation aux interactions racinaires avec les différents types de microorganismes.
- D’identifier les mécanismes du pouvoir pathogène d’Aphanomyces euteiches par des approches de génomique comparative et d’analyses moléculaires
Connections immunité-symbioses chez Medicago truncatula.
Dans leur milieu, les légumineuses peuvent être hôtes de symbiotes et/ou de parasite, successivement ou simultanément. Les deux types d’interactions donnant des réponses opposées (respectivement acceptation et rejet des microorganismes), plusieurs questions peuvent se poser.
Comment la plante fait-elle pour distinguer « amis ou ennemis » parmi les microbes dont la nature ou les signaux moléculaires émis sont proches ? Y-a-t-il des acteurs moléculaires communs utilisés par la plante en conditions symbiotiques ou pathogènes ? La présence d’un des types de microorganismes dans la plante modifie-t-elle les réponses de celle-ci vis-à-vis de l’autre catégorie de microbe, à la fois sur un plan local mais également de manière systémique?
Pour ces différentes questions, plusieurs résultats ont été obtenus dans l’équipe et/ou sont en cours d’analyse dans le cadre des projets ANR « NICE CROPS » (2015-2018) et « PSYCHE » (2017-2020). Ainsi le phénotypage avec A. euteiches (ou d’autres agents pathogènes) et l’analyse transcriptomique de mutants de symbiose infectés ont permis de montrer que le gène NFP (codant pour un des récepteurs putatifs des facteurs Nod) régule positivement la résistance de la plante. Inversement, le facteur de transcription MtNFY-A1 impliqué notamment dans la régulation du développement des nodosités, ainsi que le récepteur de cytokinines MtCRE1, sont tous deux des régulateurs négatifs de l’immunité. Des analyses GWAS sont en cours pour identifier les gènes de la plante impliqués dans la perception/réponse des différents signaux microbiens de nature chitooligosaccharidique.
Génétique de l’adaptation des plantes aux microorganismes racinaires
L’architecture génétique de la réponse des plantes aux microorganismes racinaires (pathogènes ou symbiotiques) présente une complexité qui peut être associée d’une part à une longue histoire de coévolution et d’autre part à des dynamiques probablement plus récentes liées aux changements environnementaux. Dans le but d’améliorer notre compréhension du déterminisme génétique de l’adaptation des plantes aux microorganismes racinaires, nous avons mis en place des approches génétiques à haut-débit de « Genome-Wide Association Studies » (GWAS) et de génomique des populations aux travers de « Selection Scans », à l’aide de données massives de polymorphismes SNP disponibles chez Medicago truncatula.
Le nombre et la complexité des acteurs génétiques interagissant chez les plantes pour aboutir à des réponses adaptées dans le contexte des interactions avec les microorganismes nous ont amenés à développer de nouvelles approches de génomique des populations afin d’identifier des réseaux de gènes coadaptés, en exploitant la signature génétique de la sélection sur les interactions entre gènes, à l’aide de données SNP. Suite à la phase de développement théorique actuel dans le cadre du projet ANR “DeCoD” – (2017-2021), ces méthodes pourront ensuite être appliquées à des données SNP à l’échelle du génome chez Medicago truncatula, et potentiellement à d’autres espèces de plantes.
Publications
2020
Vergnes S, Gayrard D, Veyssière M, Toulotte J, Martinez Y, Dumont V, Bouchez O, Rey T, Dumas B (2020) Phyllosphere colonisation by a soil Streptomyces promotes plant defense responses against fungal infection Mol Plant Microbe Interact 33:223-234
Faure C, Veyssière M, Boëlle B, San Clemente H, Bouchez O, Lopez-Roques C, Chaubet A, Martinez Y, Bezouška K, Suchánek M, Gaulin E, Rey T, Dumas B. (2020) Long-Read genome sequence of the sugar beet rhizosphere mycoparasite Pythium oligandrum. G3: Genes, Genomes, Genetics. doi:10.1534/g3.119.40074
Fraisier-Vannier O, Chervin J, Cabanac G, Puech-Pages V, Fournier S, Durand V, Amiel A, Andre O, Benamar OA, Tsugawa H, Dumas B, Marti G. MS-CleanR: A feature-filtering workflow for untargeted LC-MS based metabolomics. Anal. Chem. 92:9971-9981
2019
Camborde L, Raynaud C, Dumas B, Gaulin E. (2019) DNA-damaging effectors: new players in the effector arena. Trends Plant Sci. 24:1094-1101
Chervin J, Cabanac G, Audonnet M, Esquerré-Tugayé MT, Camborde L, Dumas B, Roux C, Talou T (2019) Deciphering the phylogeny of violets based on multiplexed genetic and metabolomic approaches Phytochemistry 163:99-110
Bonhomme M, Fariello MI, Navier H, Hajri A, Badis Y, Miteul H, Samac DA, Dumas B, Baranger A, Jacquet C, Pilet-Nayel ML. A local score approach improves GWAS resolution and detects minor QTL: application to Medicago truncatula quantitative disease resistance to multiple Aphanomyces euteiches Heredity 123: 517–531
Rey T, André O, Nars A, Dumas B, Gough C, Bottin A, Jacquet C. (2019) Lipo-chitooligosaccharide signalling blocks a rapid pathogen-induced ROS burst without impeding immunity. New Phytol. 221: 743-749
2018
Gaulin E, Pel JCM, Camborde L, San Clemente H, Courbier S, Dupouy MA, Lengelle J, Vayssiere M, Le Ru A, Grandjean F, Cordaux R, Moumen B, Gilbert C, Cano L, Aury JM, Guy J, Wincker P, Bouchez O, Klopp C, Dumas B (2018) Genomics analysis of Aphanomyces spp. identifies a new class of oomycete effector associated with host adaptation. BMC Biol. 16:43
Rey T, Jacquet C (2018) Symbiosis genes for immunity and vice versa. Curr. Opin. Plant Biol. 44:64-71
2017
Rey T, Bonhomme M, Chatterjee A, Gavrin A, Toulotte J, Yang W, André O, Jacquet C, Schornack S (2017) The Medicago truncatula GRAS protein RAD1 supports arbuscular mycorrhiza symbiosis and Phytophthora palmivora susceptibility. J. Exp. Bot. 68:5871-5881
Camborde L, Jauneau A, Brière C, Deslandes L, Dumas B, Gaulin E (2017) Detection of nucleic acid – protein interactions in plant leaves using fluorescence lifetime imaging microscopy. Nature Protocols 12:1933–1950
Rey T, Dumas B. (2017) Plenty is not plague : Streptomyces symbiosis with crops. Trends Plant Sci. 22:30-37
Gaulin E. (2017) Effector-mediated communication of filamentous plant pathogens with their hosts. Adv Bot Res 82:161-185
2016
Dufour MC, Magnin, N, Dumas B, Vergnes S, Corio-Costet MF (2016) High-throughput gene-expression quantification of grapevine defense responses in the field using Microfluidic Dynamic Arrays. BMC Genomics 17:957
Rey T, Laporte P, Bonhomme M, Jardinaud MF, Huguet S, Balzergue S, Dumas B, Niebel A, Jacquet C (2016) MtNF-YA1, a central transcriptional regulator of symbiotic nodule development, is also a determinant of Medicago truncatula susceptibility toward a root pathogen. Front Plant Sci 7 : 1837
Burgarella C, Chantret N, Gay L, Prosperi JM, Bonhomme M, Tiffin P, Young ND, Ronfort J. (2016) Adaptation to climate through flowering phenology : a case study in Medicago truncatula. Mol Ecol. 25:3397-415
Ramirez-Garces D, Camborde L, Pel MJ, Jauneau A, Martinez Y, Neant I, Leclerc C, Moreau M, Dumas B, Gaulin E. (2016) CRN13 candidate effectors from plant and animal eukaryotic pathogens are DNA-binding proteins which trigger host DNA damage response. New Phytol. 210:602-617.
2015
Martinez T, Texier H, Nahoum N, Lafitte C, Cioci G, Heux L, Dumas B, O’Donohue M, Gaulin E, Dumon C. (2015) Probing the functions of Carbohydrate Binding Modules in the CBEL protein from the Oomycete Phytophthora parasitica. PLoS One 10 : e0137481
Badis Y, Bonhomme M, Lafitte C, Huguet S, Balzergue S, Dumas B, Jacquet C (2015) Transcriptome analysis highlights preformed defenses and signaling pathways controlled by the prAe1 QTL, conferring partial resistance to Aphanomyces euteiches in Medicago truncatula. Mol. Plant.Pathol. 16 : 973-986
Bonhomme M, Boitard S, San Clemente H, Dumas B, Young N, Jacquet C (2015) Genomic signature of selective sweeps illuminates adaptation of Medicago truncatula to root-associated microorganisms. Mol. Biol. Evol. 2 : 2097–2110
Le Roux C, Huet G, Jauneau A, Camborde L, Tremousaygue D, Kraut A, Zhou B, Levaillant M, Adachi H, Yoshioka H, Raffaele S, Berthome R, Coute Y, Parker JE, Deslandes L (2015) A Receptor Pair with an Integrated Decoy Converts Pathogen Disabling of Transcription Factors to Immunity. Cell 161 : 1074-1088
Laffont C, Rey T, André O, Novero M, Kazmierczak T, Debellé F, Bonfante P, Jacquet C, Frugier F (2015) The CRE1 cytokinin pathway is differentially recruited depending on Medicago truncatula root environments and negatively regulates resistance to a pathogen. PLoS One. 10:e0116819
2014
Vergnes, S, Ladouce, N., Fournier, S., Ferhout, H., Attia, F., Dumas, B. (2014) Foliar treatments with Gaultheria procumbens essential oil induce defence responses and resistance against a fungal pathogen in Arabidopsis. Front. Plant Sci. 5:477
Bonhomme, M., André, O., Badis, Y., Ronfort, N., Burgarella, C., Chantret, N., Prosperi, J.M.,Briskine, R., Mudge, J., Debéllé, F., Navier, H., Miteul, H., Hajri, A., Baranger, A., Tiffin, P., Dumas, B., Pilet-Nayel, M.L., Young, N.D., Jacquet, C. (2014) High-density genome-wide association mapping identifies an F-box protein as the likely major component of Medicago truncatula resistance to Aphanomyces euteiches. New Phytol. 201:1328-42
2013
Nars A, Lafitte C, Chabaud M, Drouillard S, Mélida H, Danoun S, Le Costaouëc T, Rey T, Benedetti J, Bulone V, Barker DG, Bono JJ, Dumas B, Jacquet C, Heux L, Fliegmann J, Bottin A. (2013) Aphanomyces euteiches cell wall fractions containing novel glucan-chitosaccharides induce defense genes and nuclear calcium oscillations in the plant host Medicago truncatula. PLoS One 8:e75039
Larroque M, Belmas E, Martinez, M, Vergnes S, Ladouce N, Lafitte C, Gaulin E, Dumas B (2013) Pathogen-associated molecular pattern-triggered immunity and resistance to the root pathogen Phytophthora parasitica in Arabidopsis . J. Exp. Bot. 64 : 3615–3625
Gough C, Jacquet C (2013) Nod factor perception protein carries weight in biotic interactions. Trends Plant Sci. 18:566-574
Jiang RHY, de Bruijn I, Haas BJ, Belmonte R, Löbach L, Christie J, van den Ackerveken G, Bottin A, Bulone V, Dıaz-Moreno SM, Dumas B, Fan L, Gaulin E, Govers F, Grenville-Briggs LJ, Horner NR, Levin JZ, Mammella M, Meijer HJG, Morris P, Nusbaum C, Oome S, Phillips AJ, Rzeszutek E, van Rooyen D, Saraiva M, Secombes CJ, Seidl MF, Snel B, Stassen JHM, Sykes S, Tripathy S, van den Berg H, Vega-Arreguin JC, Wawra S, Young SK, Zeng Q, Dieguez-Uribeondo J, Russ C, Tyler BM, van West P (2013) Distinctive expansion of potential virulence genes in the genome of the oomycete fish pathogen Saprolegnia parasitica PLoS Genet. 9 : e1003272
Rey T, Nars A, Bonhomme M, Bottin A, Huguet S, Balzergue S, Jardinaud MF, Bono JJ, Cullimore J, Dumas B, Gough C, Jacquet C (2013) NFP, a LysM protein controlling Nod factor perception, also intervenes in Medicago truncatula resistance to pathogens. New Phytol. 198 : 875-886
Nars A, Rey T, Lafitte C, Vergnes S, Amatya S, Jacquet C, Dumas B, Thibaudeau C, Heux L, Bottin A, Fliegmann J (2013) An experimental system to study responses of Medicago truncatula roots to chitin oligomers of high degree of polymerization and other microbial elicitors. Plant Cell Rep. 32 : 489-502
2012
Larroque M, Barriot R, Bottin A, Barre A, Rouge P, Dumas B, Gaulin E (2012) The unique architecture and function of cellulose-interacting proteins in oomycetes revealed by genomic and structural analyses. BMC Genomics 13
2011
Jaulneau V, Lafitte C, Corio-Costet MF, Stadnik MJ, Salamagne S, Briand X, Esquerré-Tugayé, MT, Dumas B (2011) An Ulva armoricana extract protects plants against three powdery mildew pathogens Eur. J. Plant Pathol. 131 :393–401
Djébali N, Mhadhbi H, Lafitte C, Dumas B, Esquerré-Tugayé MT, Aouani ME and Jacquet C (2011) Hydrogen peroxide scavenging mechanisms are components of Medicago truncatula partial resistance to Aphanomyces euteiches Eur. J. Plant Pathol. 131 : 559-571
Larroque M, Ramirez D, Lafitte C, Borderies G, Dumas B, Gaulin E (2011) Expression and purification of a biologically active Phytophthora parasitica cellulose binding elicitor lectin in Pichia pastoris. Protein Expr Purif. 80 : 217-223
Baxter L, Tripathy S, Ishaque N, Boot N, Cabral A, Kemen E, Thines M, Ah-Fong A, Anderson R, Badejoko W, Bittner-Eddy P, Boore JL, Chibucos MC, Coates M, Dehal P, Delehaunty K, Dong S, Downton P, Dumas B, Fabro G, Fronick C, Fuerstenberg SI, Fulton L, Gaulin E, Govers F, Hughes L, Humphray S, Jiang RH, Judelson H, Kamoun S, Kyung K, Meijer H, Minx P, Morris P, Nelson J, Phuntumart V, Qutob D, Rehmany A, Rougon-Cardoso A, Ryden P, Torto-Alalibo T, Studholme D, Wang Y, Win J, Wood J, Clifton SW, Rogers J, Van den Ackerveken G, Jones JD, McDowell JM, Beynon J, Tyler BM (2010) Signatures of adaptation to obligate biotrophy in the Hyaloperonospora arabidopsidis genome. Science 330: 1549-1551
Jaulneau V, Cazaux C, Wong Sak Hoi J, Fournier S, Esquerré-Tugayé MT, Jacquet C, Dumas B (2010) Host and non-host resistance in Medicago–Colletotrichum interactions. Mol Plant-Microbe Interact 23: 1107–1117
Fammartino A, Verdaguer B, Fournier J, Tamietti G, Carbonne F, Esquerré-Tugayé MT, Cardinale F (2010) Coordinated transcriptional regulation of the divinyl ether biosynthetic genes in tobacco by signal molecules related to defense. Plant Physiol Biochem 48: 225-231
Gaulin E, Bottin A, Dumas B (2010) Sterol biosynthesis in oomycete pathogens. Plant Signal Behav 5: 258-260
Jaulneau V, Lafitte C, Jacquet C, Fournier S, Salamagne S, Briand X, Esquerré-Tugayé MT, Dumas B (2010) Ulvan, a sulfated polysaccharide from green algae, activates plant immunity through the jasmonic acid signaling pathway. J Biomed Biotech 10: 525291
Levesque CA, Brouwer H, Cano L, Hamilton JP, Holt C, Huitema E, Raffaele S, Robideau GP, Thines M, Win J, Zerillo MM, Beakes GW, Boore JL, Busam D, Dumas B, Ferriera S, Fuerstenberg SI, Gachon CM, Gaulin E, Govers F, Grenville-Briggs L, Horner N, Hostetler J, Jiang RH, Johnson J, Krajaejun T, Lin H, Meijer HJ, Moore B, Morris P, Phuntmart V, Puiu D, Shetty J, Stajich JE, Tripathy S, Wawra S, van West P, Whitty BR, Coutinho PM, Henrissat B, Martin F, Thomas PD, Tyler BM, De Vries RP, Kamoun S, Yandell M, Tisserat N, Buell CR (2010) Genome sequence of the necrotrophic plant pathogen Pythium ultimum reveals original pathogenicity mechanisms and effector repertoire. Genome Biol 11: R73
Schornack S, van Damme M, Bozkurt TO, Cano LM, Smoker M, Thines M, Gaulin E, Kamoun S, Huitema E (2010) Ancient class of translocated oomycete effectors targets the host nucleus. Proc Natl Acad Sci USA 107: 17421-17426
Wong Sak Hoi J, Dumas B (2010) The STE12 and STE12-like proteins: fungal transcription factors regulating development and pathogenicity. Eukaryot Cell 9: 480-485
2009
Djebali N, Jauneau A, Ameline-Torregrosa C, Chardon F, Jaulneau V, Mathe C, Bottin A, Cazaux M, Pilet-Nayel ML, Baranger A, Aouani ME, Esquerré-Tugayé MT, Dumas B, Huguet T, Jacquet C (2009) Partial resistance of Medicago truncatula to Aphanomyces euteiches is associated with protection of the root stele and is controlled by a major QTL rich in proteasome-related genes. Mol Plant Microbe Interact 22: 1043-1055
Madoui MA, Bertrand-Michel J, Gaulin E, Dumas B (2009) Sterol metabolism in the oomycete Aphanomyces euteiches, a legume root pathogen. New Phytol 183: 291-300
Pilet-Nayel ML, Prosperi JM, Hamon C, Lesne A, Lecointe R, Le Goff I, Herve M, Deniot G, Delalande M, Huguet T, Jacquet C, Baranger A (2009) AER1, a major gene conferring resistance to Aphanomyces euteiches in Medicago truncatula. Phytopathology 99: 203-208
Tollot M, Wong Sak Hoi J, van Tuinen D, Arnould C, Chatagnier O, Dumas B, Gianinazzi-Pearson V, Seddas PM (2009) An STE12 gene identified in the mycorrhizal fungus Glomus intraradices restores infectivity of a hemibiotrophic plant pathogen. New Phytol 181: 693-707
2008
Ameline-Torregrosa C, Cazaux M, Danesh D, Chardon F, Cannon SB, Esquerre-Tugaye MT, Dumas B, Young ND, Samac DA, Huguet T, Jacquet C (2008) Genetic dissection of resistance to anthracnose and powdery mildew in Medicago truncatula. Mol Plant Microbe Interact 21: 61-69
Badreddine I, Lafitte C, Heux L, Skandalis N, Spanou Z, Martinez Y, Esquerré-Tugayé MT, Bulone V, Dumas B, Bottin A (2008) Cell wall chitosaccharides are essential components and exposed patterns of the phytopathogenic oomycete Aphanomyces euteiches. Eukaryot Cell 7: 1980-1993
Dumas B, Bottin A, Gaulin E, Esquerre-Tugaye MT (2008) Cellulose-binding domains: cellulose associated-defensive sensing partners? Trends Plant Sci 13: 160-164
Gaulin E, Madoui MA, Bottin A, Jacquet C, Mathé C, Couloux A, Wincker P, Dumas B (2008) Transcriptome of Aphanomyces euteiches: new oomycete putative pathogenicity factors and metabolic pathways. PLoS ONE 3: e1723
2007
Fammartino A, Cardinale F, Gobel C, Mene-Saffrane L, Fournier J, Feussner I, Esquerre-Tugaye MT (2007) Characterization of a divinyl ether biosynthetic pathway specifically associated with pathogenesis in tobacco. Plant Physiol 143: 378-388
Gaulin E, Haget N, Khatib M, Herbert C, Rickauer M, Bottin A (2007) Transgenic sequences are frequently lost in Phytophthora parasitica transformants without reversion of the transgene-induced silenced state. Can J Microbiol 53: 152-157
Gaulin E, Jacquet C, Bottin A, Dumas B (2007) Root rot disease of legumes caused by Aphanomyces euteiches. Mol Plant Pathol 8: 539-548
Madoui MA, Gaulin E, Mathé C, San Clemente H, Couloux A, Wincker P, Dumas B (2007) AphanoDB: a genomic resource for Aphanomyces pathogens. BMC Genomics 8: 471
Djebali N, Mhadhbi H, Jacquet C, Huguet T, Aouani ME (2007) Involvement of hydrogen peroxide, peroxidase and superoxide dismutase in response of Medicago truncatula lines differing in susceptibility to Phoma medicaginis infection. J. Phytopathol 155: 633-640
Wong Sak Hoi JW, Herbert C, Bacha N, O’Connell R, Lafitte C, Borderies G, Rossignol M, Rougé P, Dumas B (2007) Regulation and role of a STE12-like transcription factor from the plant pathogen Colletotrichum lindemuthianum. Mol Microbiol 64: 68-82
2006
Ameline-Torregrosa C, Dumas B, Krajinski F, Esquerre-Tugaye MT, Jacquet C (2006) Transcriptomic approaches to unravel plant-pathogen interactions in legumes. Euphytica 147 : 25-36
Gaulin E, Dramé N, Lafitte C, Torto-Alalibo T, Martinez Y, Ameline-Torregrosa C, Khatib M, Mazarguil H, Villalba-Mateos F, Kamoun S, Mazars C, Dumas B, Bottin A, Esquerré-Tugayé MT, Rickauer M (2006) Cellulose binding domains of a Phytophthora cell wall protein are novel pathogen-associated molecular patterns. Plant Cell 18 : 1766-1777
2005
Boudart G, Jamet E, Rossignol M, Lafitte C, Borderies G, Jauneau A, Esquerré-Tugayé MT, Pont-Lezica R (2005) Cell wall proteins in apoplastic fluids of Arabidopsis thaliana rosettes : identification by mass spectrometry and bioinformatics. Proteomics 5 : 212-221
Colditz F, Braun HP, Jacquet C, Niehaus K, Krajinski F (2005) Proteomic profiling unravels insights into the molecular background underlying increased Aphanomyces euteiches-tolerance of Medicago truncatula. Plant Mol Biol 59 : 387-406
Prost I, Dhondt S, Rothe G, Vicente J, Rodriguez MJ, Kift N, Carbonne F, Griffiths G, Esquerre-Tugaye MT, Rosahl S, Castresana C, Hamberg M, Fournier J (2005) Evaluation of the antimicrobial activities of plant oxylipins supports their involvement in defense against pathogens. Plant Physiol 139 : 1902-1913
Siriputthaiwan P, Jauneau A, Herbert C, Garcin D, Dumas B (2005) Functional analysis of CLPT1, a Rab/GTPase required for protein secretion and pathogenesis in the plant fungal pathogen Colletotrichum lindemuthianum. J Cell Sci 118 : 323-329
2004
Cluzet S, Torregrosa C, Jacquet C, Lafitte C, Fournier J, Mercier L, Salamagne S, Briand X, Esquerré-Tugayé MT, Dumas B (2004) Gene expression profiling and protection of Medicago truncatula against a fungal infection in response to an elicitor from the green algae Ulva spp. Plant Cell Environ 27 : 917-928
Herbert C, O’Connell R, Gaulin E, Salesses V, Esquerre-Tugaye MT, Dumas B (2004) Production of a cell wall-associated endopolygalacturonase by Colletotrichum lindemuthianum and pectin degradation during bean infection. Fungal Genet Biol 41 : 140-147
Khatib M, Lafitte C, Esquerré-Tugayé MT, Bottin A, Rickauer M (2004) The CBEL elicitor of Phytophthora parasitica var. nicotianae activates defence in Arabidopsis thaliana via three different signalling pathways. New Phytol. 162 : 501-510
O’Connell R, Herbert C, Sreenivasaprasad S, Khatib M, Esquerré-Tugayé MT, Dumas B (2004) A novel Arabidopsis–Colletotrichum pathosystem for the molecular dissection of plant-fungal interactions. Mol Plant Microbe Interact 17 : 272-282
Torregrosa C, Cluzet S, Fournier J, Huguet T, Gamas P, Prosperi JM, Esquerré-Tugayé MT, Dumas B, Jacquet C (2004) Cytological, genetic, and molecular analysis to characterize compatible and incompatible interactions between Medicago truncatula and Colletotrichum trifolii. Mol Plant Microbe Interact 17 : 909-920
2003
Borderies G, Jamet E, Lafitte C, Rossignol M, Jauneau A, Boudart G, Monsarrat B, Esquerré-Tugayé MT, Boudet A, Pont-Lezica R (2003) Proteomics of loosely bound cell wall proteins of Arabidopsis thaliana cell suspension cultures : a critical analysis. Electrophoresis 24 : 3421-3432
Boudart G, Charpentier M, Lafitte C, Martinez Y, Jauneau A, Gaulin E, Esquerré-Tugayé MT, Dumas B (2003) Elicitor activity of a fungal endopolygalacturonase in tobacco requires a functional catalytic site and cell wall localization. Plant Physiol 131 : 93-101
Mène-Saffrané L, Esquerré-Tugayé MT, Fournier J (2003) Constitutive expression of an inducible lipoxygenase in transgenic tobacco decreases susceptibility to Phytophthora parasitica var. nicotianae. Mol Breeding 12 : 271-282
Theses
Thèses en cours
M. Hashemi Effect of mycoparasite and root endophyte Pythium oligandrum on plant root-microbe interactions
A. Kiselev Molecular mechanisms of the interaction of the oomycete Aphanomyces euteiches with its environment and its plant host
C. Nicolle Rôle des Streptomyces racinaires dans le fonctionnement du microbiote racinaire
Thèses soutenues
L. Camborde (2020) Caractérisation fonctionnelle e différents effecteurs candidats de l’oomycète Aphanomyces euteiches, parasite racinaire des légumineuses
C. Faure (2020) Mécanismes cytologiques et moléculaires du pouvoir pathogène de Pythium oligandrum, oomycète mycoparasite
D. Gayrard (2020) Activités stimulatrices des défense de plantes et antifongique d’une souche de Streptomyces sp. utilisée en tant qu’agent de biocontrôle
T. Martinez (2015) Les oomycètes, microorganismes pathogènes de plantes : nouvelles ressources biotechnologiques pour l’exploitation de la biomasse ligno-cellulosique
Y. Badis, (2014) Déterminants génétiques de la résistance de Medicago truncatula à Aphanomyces euteiches
D. Ramirez, (2014) Analyse des effecteurs Crinklers (CRN) de l’oomycète Aphanomyces euteiches.
O. André (2014) Analyse génétique de la résistance quantitative de Medicago truncatula au parasite racinaire Aphanomyces euteiches.
A. Nars, (2013) Caractérisation structurale et perception par la plante hôte Medicago truncatula des chitosaccharides pariétaux d’Aphanomyces euteiches, parasite de légumineuses. Lire
T. Rey, (2013) Mise en évidence et caractérisation d’interconnexions moléculaires entre symbiose et résistance chez la légumineuse modèle Medicago truncatula
M. Larroque, (2008-2011) Mécanismes de surveillance de l’intégrité pariétale et rôle dans l’induction des défenses des plantes. Lire
V. Jaulneau, (2010) Mode d’action de nouvelles molécules stimulatrices des défenses des plantes. (Confidentielle)
M. Cazaux, (2009) Analyse génétique de la résistance de la légumineuse Medicago truncatula à Colletotrichum trifolii. Lire
M.A. Madoui, (2009) Génomique fonctionnelle de l’interaction Medicago truncatula/Aphanomyces euteiches Lire
I. Badreddine, (2008) Etudes des surfaces cellulaires d’Aphanomyces euteiches parasite de légumineuses.Lire
N. Djébali, (2008) Etude des mécanismes de résistance de la plante modèle Medicago truncatula vis-à-vis de deux agents pathogènes majeurs des légumineuses cultivées : Phoma medicaginis et Aphanomyces euteiches. Lire
J. Wong Sak Hoi, (2007). Analyse fonctionnelle du facteur de transcription CLSTE12, impliqué dans le pouvoir pathogène du champignon phytopathogène Colletotrichum lindemtuhianum.
P.Siriputthaiwan, (2005). Sécrétion de protéines et pouvoir pathogène des champignons parasites de plantes : rôle d’une Rab/GTPase impliquée dans le transport vésiculaire.
C. Torregrosa, (2004) Caractérisation cytologique, génétique et moléculaire de l’interaction Colletotrichum trifolii/Medicago truncatula.
M. Khatib (2004) Expression par transgenèse d’un éliciteur de Phytophthora dans le Tabac et Arabidopsis et étude du phénotype.
C. Herbert (2003) Analyse moléculaire de la régulation de l’expression des gènes codant les endopolygalacturonases de Colletotrichum lindemuthianum, agent de l’anthracnose du Haricot.
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